ВОПРОСЫ ПО ОПЛАТЕ ТРУДА

Никак.

Закон не предусматривает удержаний из зарплаты в виде штрафа, применять его нельзя.

Почему так.

Во-первых, штрафы - прерогатива государственных органов, у работодателей таких полномочий нет.
Во-вторых, это ухудшение условий работника в нарушение ст. 8 ТК РФ. Поэтому даже если включить механизм штрафования в ЛНА, все равно именно штрафовать нельзя.

Что можно сделать.

Можно снизить премию до 20% за дисциплинарный проступок.
Взыскание оформляется по правилам ст. 193 ТК РФ.
Это значит, что наказать можно за виновные действия. Для этого проступок нужно выявить, изучить обстоятельства совершения и учесть его тяжесть, установить виновность и оценить последствия. Оформить взыскание требуется не позднее 1 месяца со дня обнаружения.

Важно.
Если последствия негативны для компании: например, опоздал (проступок) - не открыл вовремя магазин (виновность) - компания потеряла выручку (последствия) - то взыскание налагается и по решению применяется мера по снижению премии.
Если последствий нет, опоздание работника не изменило результат, то взыскание спорно и рублем наказать не получится. Только словом.